Moderní metabolické inženýrství si klade za cíl navrhnout nové mikrobiální kmeny, které produkují produkty s komerční hodnotou s vysokým výnosem. Opírá se o integraci mikrobiální fyziologie, genetického inženýrství, systémové biologie a výpočetní biologie. Protože metabolická dráha tvořící produkt soutěží o energetické zdroje s růstovými procesy, růst a tvorba produktu jsou spojeny. Toto spojení komplikuje návrh cest tvorby produktu, protože často přináší nežádoucí vedlejší účinky.
V tomto projektu se snažíme omezit toto spojení tím, že cesta tvorby produktu bude závislá na vlastním intracelulárním zdroji energie. I když se tím více zapojuje genetické inženýrství, odděluje to buněčný růst a tvorbu produktu.
Budete zodpovědní za výpočetní predikci slibných geneticko-inženýrských strategií metabolismu pomocí stechiometrických modelů metabolismu na úrovni genomu a enzymokinetických úvah a budete to hlásit ostatním členům konsorcia, kteří zkonstruují odpovídající mikrobiální kmeny.
Budete pracovat v konsorciu doktorandů a odborných školitelů, kteří se zabývají genetickým inženýrstvím enzymových aktivit, genetickým inženýrstvím metabolických drah a fyziologií geneticky upravených kmenů.
Vaše povinnosti
- Provádět výpočetní studie metabolického inženýrství a radit genetickým inženýrům ohledně nových návrhů metabolických sítí v S.cerevisiae a E. coli pro oddělení růstu a tvorby produktu s alternativními redoxními faktory pomocí metod stechiometrického modelování na úrovni genomu
- Použijte úvahy o kinetice enzymů a matematické modely k vyhodnocení regulačních důsledků přepracovaných metabolismů
- Spolupracujte s experimentátory pracujícími na stejném projektu na genetickém inženýrství a fyziologickém hodnocení výkonnosti geneticky upravených kmenů
- Práce na obecné teorii aplikace alternativního redoxu pro biotechnologické účely
Požadavky:
- Máte titul MSc z metabolického inženýrství, biotechnologie, systémové biologie nebo výpočetní biologie
- Fascinuje vás logika mikrobiálního metabolismu
- Máte zkušenosti s matematickým modelováním metabolismu, preferujete stechiometrické modelování metabolismu na úrovni genomu
- Užíváte si společný výzkum, který je základní i aplikovaný.
Platové výhody:
Náročná pozice v společensky angažované organizaci. Plat bude v souladu s univerzitními předpisy pro akademické pracovníky a činí 2 541 EUR (PhD) měsíčně během prvního roku a zvyšuje se na 3 247 EUR (PhD) měsíčně během čtvrtého roku na základě plného úvazku. zaměstnanost. Pracovní profil je založen na univerzitním systému hodnocení pracovních pozic a je volná alespoň 1 FTE.
Schůzka bude zpočátku trvat 1 rok. Po uspokojivém vyhodnocení prvního jmenování bude smlouva prodloužena na dobu 4 let.
Vrije Universiteit Amsterdam navíc nabízí vynikající okrajové výhody a různé programy a předpisy na podporu dobré rovnováhy mezi pracovním a soukromým životem, jako například:
- maximálně 41 dní dovolené za kalendářní rok na základě zaměstnání na plný úvazek
- 8% příspěvek na dovolenou a 8,3% bonus na konci roku
- příspěvek na dojíždění
- slevy na kolektivní pojištění (zdravotní a autopojištění)
- volitelný model pro navrhování personalizovaného balíčku výhod
Pracovní doba:
38 hodin týdně
Adresa:
De Boelelaan 1105